回到家禽和禽舍管理的基礎是克服球蟲病和其他影響使用養殖（NAE）體系的生產者的健康問題的關鍵。
奧本大學家禽科學教授Joseph Giambrone博士說，球蟲病導致壞死性腸炎（NE）一直是使用NAE生產系統的生產者面臨的一個主要問題。然而，確定在營養、生物安全和墊料質量方面的改進意味著該行業能夠在應對這些疾病方面取得重大進展。他說：“基本的健康管理和生物安全都有很長的路要走”。Giambrone在接受《Poultry Health Today》采訪時表示，許多生產者已經邁出了重要的一步，認識到壞死性腸炎不僅繼發于球蟲病，而且還與其他可能刺激腸道的問題有關，如飼料膳食纖維和飼料顆粒大小。這促使該行業的許多人考慮通過減少在飼料中使用（DDGS）、添加更好的酶來消化纖維，以及在孵化場為家禽接種球蟲病疫苗來改善家禽的飼料。
他說：“其他人也在考慮更好的生物安全等問題。這些措施包括穿上防護鞋，控制害蟲，通過使用更干燥的墊料來減少墊料中的病原微生物，更好地控制空氣，以及更好地處理飼料和飲水。”
“這很復雜，不同農場的情況不同，這就是為什么在某些情況下人們使用益生菌和益生元，有時有效，有時無效，所以它必須量身定制，就像免疫程序一樣。”Giambrone說，正確使用無抗養殖體系的最大管理領域之一是墊料質量。“梭狀芽孢桿菌是壞死性腸炎的主要病原，但也有梭狀芽孢桿菌可以導致壞疽性皮炎。雞場也有大腸桿菌，可以是腸道疾病或敗血癥。很多這樣的病變最終會在加工廠被廢棄。”他補充說，還有一些對公眾健康至關重要的潛在問題，比如沙門氏菌和彎曲桿菌，需要加以考慮。“雖然它們在家禽中不引起疾病問題，但可能會出現在受污染的胴體和雞蛋中，如果消費者沒有正確處理它們，那么最終會出現食品安全問題。”Giambrone說，隨著越來越多的消費者選擇無抗養殖的產品，這些挑戰將會持續存在，所以在農場學習應對這些感染的方法至關重要。“最初被禁用的抗生素是促生長類抗生素……但它們也控制了壞死性腸炎……所以當這些抗生素被禁用時，后果是這些疾病增加。”
