次級淋巴器官包括：骨髓、脾臟、哈德氏腺、結(jié)膜相關(guān)淋巴組織，支氣管相關(guān)淋巴組織和腸道相關(guān)淋巴組織。

骨髓是造血器官，也是重要的免疫器官。骨髓能產(chǎn)生一種特殊的細(xì)胞，叫“多功能干細(xì)胞”，它隨血液運(yùn)行到機(jī)體不同部位，分化為不同的免疫細(xì)胞，例如運(yùn)行到法氏囊就分化演變?yōu)锽淋巴細(xì)胞，運(yùn)行到胸腺就分化為T淋巴細(xì)胞，體內(nèi)所有免疫細(xì)胞均由它分化而成。此外，骨髓本身也是多功能干細(xì)胞分化為某些免疫細(xì)胞的場所。

脾臟位于腺胃右上方，成年雞的脾臟約有白果大，呈棕紅色，近于球形。脾臟內(nèi)有來自法氏囊的B細(xì)胞和來自胸腺的T細(xì)胞，是免疫應(yīng)答的重要場所，也是產(chǎn)生抗體和效應(yīng)細(xì)胞的重要場所。

淋巴組織肉眼明顯可見的只有盲腸扁桃體，此外許多器官的粘膜層均有彌散性淋巴組織，眼部的哈德爾氏腺淋巴組織最為豐富。

免疫系統(tǒng)是指存在于雞體內(nèi)具有免疫功能的器官、組織、細(xì)胞(淋巴細(xì)胞等)和分子(抗體)組成的完整解剖系統(tǒng)、并具有一定生理功能的結(jié)構(gòu)。免疫系統(tǒng)主要包括參與免疫應(yīng)答的中樞免疫器官、外周免疫器官和各種免疫細(xì)胞。雞及其他鳥類的免疫器官的結(jié)構(gòu)和功能與哺乳類動物基本相似，但也存有一定的差異，其中最為重要的差別是鳥類有一個特殊的免疫器官—法氏囊；另外，雞和大部分鳥類沒有淋巴結(jié)而只有集合淋巴組織。